Зимой 2013 года в карьере талантливого полузащитника начался новый виток – он впервые покинул Южную Америку и отправился в Европу защищать черно-зеленые цвета нашего клуба. В конце февраля 2013 года Маурисио Перейра подписал личный контракт с «Краснодаром», который в апреле 2015 года был продлен до лета 2019 года.